Eğitmenler
Fadime Öztoprak
Erciyes Üniversitesi Biyoloji Bölümünden mezun oldum. Yüksek lisansımı Erciyes Üniversitesinde kloroplast DNA analizi ile Phlomis L. (Lamiaceae) cinsine ait türler arasındaki doğal hibridizasyonun incelenmesi üzerine tamamladım. Şuan Dokuz Eylül Üniversitesi, Izmir Uluslararası Biyotıp ve Genom Enstitüsünde doktora öğrencisiyim. Araştırmalarımda multi-omik entegresyon, moleküler sinyal yolakları, fonksiyonel zenginleştirme analizleri, ağ-bazlı gen zenginleştirme analizi gibi yaklaşımları ile yenilikçi tedavi hedefleri üzerine odaklanıyorum. 2017 yılından bu yana Coursera'da Genomik Teknolojilere Giriş (Introduction to Genomic Technologies) kursunda danışmanlık yapıyorum. 2018 yılında Erasmus+ staj programı ile Birleşik Krallık merkezli, yaşam bilimlerinde bilgi teknolojileri odaklı “Precisionlife” firmasının Varşova biriminde uygulama geliştirme yaz stajyeri (Junior Application Developer Summer Intern) olarak bulundum. Burada bilimin ürettiği verileri günlük hayatta uygulamaya geçirmeyi hedefleyen üç farklı projeye katkı sağladım. 2019 yılında Odetta.ai bünyesindeki projelerde veri analisti olarak serbest zamanlı çalışmaya başladım.
Kaan Okay
Liseyi İzmir’de okul birincisi olarak tamamladıktan sonra bölüm birincisi olarak da Atatürk Üniversitesi Moleküler Biyoloji ve Genetik bölümünü bitirdim. Şuanda Dokuz Eylül Üniversitesi, İzmir Uluslararası Biyotıp ve Genom Enstitüsü’nde yüksek lisansımı Dr.Öğr.Üyesi Yavuz Oktay ve Doç.Dr. Gökhan Karakülah’ın danışmanlığında, otizmli çocuklar ve aileleri arasındaki alternatif splicing farklılıklarının co-eksprese olan genler üzerine etkisini araştırmak üzere yapmaktayım. Tez çalışmalarıma ek olarak otizmli çocuklar ve aileleri arasındaki transposable elementlerinin ifade farklılıkları üzerine çalışmakla birlikte glioblastoma’lardaki epigenetik değişimlerin gen ifadesi değişimleri üzerine etkilerini incelemek için de çalışmaktayım. Ayrıca nadir nörolojik hastalıklar üzerine alternatif splicing ve gen ifadesi değişimlerini içeren çalışmalara da katkı sunmaktayım.
2019 Kasım ayından beri ISCB RSG Turkey biyoinformatik öğrenci topluluğunun sekreterliğini yürütmekteyim. Topluluğumuzun hesaplamalı biyoloji ve biyoinformatik alanlarında yaptığı/desteklediği faaliyetlere dolaylı yada doğrudan destek olmaktayım.
Aadil Javed
Lisans eğitimimi Lahor Veterinerlik ve Hayvan Bilimleri Üniversitesi, Biyoteknoloji ve Biyoinformatik Bölümünde onur derecesi ile tamamladım. Yüksek lisansımı İslamabad’da bulunan Ulusal Bilim ve Teknoloji Üniversitesi’nde Gümüş Nanoparçacıkların Mikozentezi,
Karakterizasyonu ve Terapötik Potansiyellerinin Değerlendirilmesi üzerine tamamladıktan
sonra Türkiye bursunu kazarak Ege Üniversitesi Biyomühendislik Bölümü, Biyoteknoloji Departmanında doktora eğitimime başladım. Şu anda moleküler ve hücresel biyoloji tekniklerini kullanarak Floresan Ubikitinasyon Tabanlı Hücre Döngüsü İnhibitörü (FUCCI) sistemine dayanan kararlı kanser hücre hatları oluşturmaya çalışıyorum. Türkiye’ye gelmeden önce İslamabad’daki Oxford lisesinde biyoloji, kimya ve fizik dersleri verdim.
Ayrıca İslamabad Tanı Merkezinde tıbbi laboratuvar asistanı olarak çalıştım.
Uğur Çabuk
Lisans derecesini Bolu Abant İzzet Baysal Üniversitesi Biyoloji bölümünde kazandım. Şu anda Bolu Abant İzzet Baysal Üniversitesi Fen Bilimleri Enstitüsü Biyoloji Anabilim dalında yüksek lisans öğrencisi olarak, çalışmalarımı Profesör Nusret Zencirci ve Öğretim Üyesi Dr. Ercan Selçuk Ünlü ’nün danışmanlığında, Fonksiyonel Genomik laboratuvarında tüm genom bakteri analizi üzerine yapmaktayım.
Tez dışında, bulunduğum ve işbirliği yaptığım projeler kapsamında ilgi alanlarım, Büyük veri analizi,
Makine Öğrenimi, Varyant Analizi, Genom Anotasyonu ve yeni Biyoinformatik araçlar geliştirme.
Bu zamana kadar,
2018 yılında ve hala devam etmekte olan, Dr. Yasin Bakış (Tulane University, Senior Manager of Biodiversity Department, Amerika) danışmanlığında bitki sınıflandırmasında yeni bir yöntem, 2019 yılında Profesör Jan Komorowski (Uppsala Universitet, Head of Bioinformatics Department, İsveç) danışmanlığında omiks veri üzerinde makine öğrenimi yöntemiyle glioma alt-tiplerinin tahmini, gibi projelerde bulundum ve işbirliği sağladım.